麝、黑麂、豚鹿、梅花鹿、西藏馬鹿（包括白臀鹿）、塔里木馬鹿、坡鹿、白唇鹿、麋鹿、駝鹿、野牛、爪哇野牛、野牦牛、蒙原羚、普氏原羚、藏羚、高鼻羚羊、秦嶺羚牛、四川羚牛、不丹羚牛、貢山羚牛、赤斑羚、喜馬拉雅斑羚、塔爾羊、西藏盤羊、臺灣鬣羚、喜馬拉雅鬣羚

嚙齒目：河貍

海牛目：儒艮

鯨目：北太平洋露脊鯨、灰鯨、藍鯨、小須鯨、塞鯨、布氏鯨、大村鯨、長須鯨、大翅鯨、白鱀豚、恒河豚、中華白海豚、長江江豚、抹香鯨

鳥綱

雞形目：四川山鷓鴣、海南山鷓鴣、斑尾榛雞、黑嘴松雞、黑琴雞、紅喉雉鶉、黃喉雉鶉、黑頭角雉、紅胸角雉、灰腹角雉、黃腹角雉、棕尾虹雉、白尾梢虹雉、綠尾虹雉、藍腹鷴（藍鷴）、褐馬雞、白頸長尾雉、黑頸長尾雉、黑長尾雉、白冠長尾雉、灰孔雀雉、海南孔雀雉、綠孔雀

雁形目：青頭潛鴨、中華秋沙鴨、白頭硬尾鴨

鴿形目：小鵑鳩

鴇形目：大鴇、波斑鴇、小鴇

鶴形目：白鶴、白枕鶴、赤頸鶴、丹頂鶴、白頭鶴、黑頸鶴

鸻形目：小青腳鷸、勺嘴鷸、黑嘴鷗、遺鷗、中華鳳頭燕鷗、黃嘴河燕鷗

鹱形目：黑腳信天翁、短尾信天翁

鸛形目：彩鸛、黑鸛、白鸛、東方白鸛

鰹鳥目：白腹軍艦鳥

鵜形目：黑頭白鹮、白肩黑鹮、朱鹮、彩鹮、黑臉琵鷺、海南鳽、白腹鷺、黃嘴白鷺、白鵜鶘、斑嘴鵜鶘、卷羽鵜鶘

鷹形目：胡兀鷲、白背兀鷲、黑兀鷲、禿鷲、烏雕、草原雕、白肩雕、金雕、白腹海雕、玉帶海雕、白尾海雕、虎頭海雕

鸮形目：毛腿雕鸮、四川林鸮

犀鳥目：白喉犀鳥、冠斑犀鳥、雙角犀鳥、棕頸犀鳥、花冠皺盔犀鳥

隼形目：獵隼、矛隼

雀形目：黑頭噪鴉、灰冠鴉雀、金額雀鹛、黑額山噪鹛、白點噪鹛、藍冠噪鹛（靛冠噪鹛）、黑冠藪鹛、灰胸藪鹛、棕頭歌鴝、栗斑腹鹀、黃胸鹀

爬行綱

龜鱉目：緬甸陸龜、凹甲陸龜、四爪陸龜、紅海龜、綠海龜、玳瑁、太平洋麗龜、棱皮龜、黿、斑鱉

有鱗目：大耳沙蜥、鱷蜥、孟加拉巨蜥、圓鼻巨蜥、西藏溫泉蛇、香格里拉溫泉蛇、四川溫泉蛇、莽山烙鐵頭蛇

鱷目：揚子鱷

兩棲綱

有尾目：安吉小鯢、中國小鯢、掛榜山小鯢、貓兒山小鯢、普雄原鯢、遼寧爪鯢、鎮海棘螈

硬骨魚綱

鱘形目：中華鱘、長江鱘、鰉、白鱘

鯡形目：鰣

鯉形目：北方銅魚、扁吻魚

鲇形目：長絲𩷶

鮭形目：川陜哲羅鮭

鱸形目：黃唇魚

腸鰓綱

柱頭蟲目：多鰓孔舌形蟲、黃島長吻蟲

昆蟲綱

蛩蠊目：中華蛩蠊、陳氏西蛩蠊

鱗翅目：金斑喙鳳蝶

雙殼綱

簾蛤目：大硨磲

頭足綱

鸚鵡螺目：鸚鵡螺

珊瑚綱

軟珊瑚目：紅珊瑚科所有種