國務院學位委員會學科評議組成員、國家自然科學獎評委、國家科技進步獎評委、中國藥典委員會委員、國際和國內學術團體的領導、國家新藥評審委員會委員以及全國性、國際性期刊雜志的正副主編，在國內外享有較高聲譽。
學校下設藥學院、中藥學院、生命科學和技術學院、國際醫藥商學院、成人教育學院、高等職業技術學院、基礎部、社會科學部、體育部、外語系等10個院部系。有23個博士點，其中藥物化學、生藥學、藥劑學3個學科為國家重點學科點，現代中藥學與天然藥物學學科是江蘇省11個重中之重學科之一；設有藥學博士后流動站，14個學科專業可招收博士后研究人員；有26個碩士點；設置15個本科專業以及“國家基礎科學研究與教學人才培養基地基礎藥學專業點”和“國家生命科學與技術人才培養基地”。學校是教育部指定接受藥學學科外國來華留學生、進修生和高級訪問學者的唯一基地，也是教育部批準可以接受華僑、港澳地區及臺灣省學生的定點院校之一。學校的高等職業技術學院是教育部確定的全國首批15所示范性職業技術學院建設單位之一。
2002年“國家基礎科學研究與教學人才培養基地基礎藥學專業點”被教育部評為“優秀基地”。生藥學被評為2003年度國家精品課程。2003年學校的藥學、制藥工程、中藥學3個本科專業被評為江蘇省品牌專業建設點，藥物制劑、生物工程2個本科專業被評為江蘇省特色專業建設點。
學校科學研究堅持“強化基礎、加強應用，推動創新，促進聯合”的指導思想，立足國際前沿，充分發揮藥學、中藥學學科齊全的優勢，通過學科群建設，促進了學科的交叉、滲透，顯著提高了科技攻關和科技創新能力。學校獲得國家、省、部級科技成果獎100多項，獲得國家新藥證書100多本，不少科技成果達到國際先進水平，其中由中國科學院院士徐國鈞教授主持的“常用中藥材品種整理和質量研究”榮獲國家科技進步一等獎。98年至今，承擔的國家“863”項目、“973”項目、國家自然科學基金重點項目等項目數，在國內同類院校和科研院所中位居前列。
學校面向教育國際化和科學技術迅猛發展的趨勢，面對醫藥經濟發展對高等藥學教育的新要求，不斷深化教育教學改革，努力提高人才培養質量。“九五”以來，承擔了國家“面向21世紀教學內容程與課程體系改革”課題6項，“世行貸款---21世紀初高等教育教學改革”課題3項以及一批省校級教育教學改革項目，形成了一批優秀的教學成果，有30多項教學成果（含優秀教材）獲國家、省、部級獎勵，其中由校長吳曉明教授主持的“高等藥學教育面向21世紀人才培養模式的研究與實踐”獲國家級優秀教學成果一等獎。
圖書館建筑面積13000平米，藏書70萬冊，有中外期刊4000余種。近年來，學校加強以數字化建設和信息化服務為特征，藥學為特色的圖書文獻信息保障系統建設，構建先進數字圖書館公共服務平臺，逐步實現傳統圖書館向數字圖書館的轉變。
學校建有聯合國人口控制藥物質量研究培訓中心、國家科技部新藥篩選實驗室、國家科技部藥物代謝研究技術平臺、國家酶工程技術工業性試驗基地、現代中藥教育部重點實驗室（建設）等9個部、省級重點實驗室。有500兆周和300兆周的核磁共振波譜儀各1臺，LC-Q-TOF、液相色譜--三級四極桿質譜聯用儀等液相色譜—質譜聯用儀7臺，以及諸如：蛋白質組儀、計算機輔助藥物設計系統等一批先進的科研儀器。
學校建有校園計算機網絡，有滿足教學需要的計算機室、語音室、多媒體教室。有一批裝備精良的本科生教學實驗室。有制藥有限公司、藥用植物園、中藥標本館、符合GMP要求的實訓基地等教學實踐基地。在江蘇、浙江、山東省，上海、天津市的一些著名醫藥企業建立了大學生教育實踐基地。
學校高度重視學生綜合素質的培養，形成了“嚴謹、求實、團結、創新”的優良校風。畢業生以其敬業精神好、知識面寬、能力強和素質高，贏得了社會的廣泛好評和歡迎。2002年在江蘇省高校中，研究生畢業生就業率排名與其他高校并列第一，本科生、專科生分別排名第一，位列教育部公布的就業率第一層次。2003年在教育部直屬高校中，研究生、本科生就業率排名第一、專科生就業率97.32%，總就業率排名第一。
學校國際學術交流頻繁活躍，先后與日本、美國、英國、意大利、澳大利亞、比利時、香港等多個國家和地區的23所學校和科研院所簽訂了校際學術交流協議，還同德國、法國、俄羅斯、韓國、瑞士、瑞典、加拿大、香港、澳門等30多個國家和地區的有關院校及科研機構有學術上的聯系。為五大洲34個國家培養博士、碩士、本科生，進修生400多人。
學校積極探索建立教育、科技主動適應社會主義市場經濟發展的新機制，與許多大中型醫藥企業建立長期合作關系。近5年來，科研成果已轉化為生產力的科研項目有100余項，為醫藥企業創造了數十億元的產值，學校獲轉讓費近億元。
學校正認真貫徹國家科教興國方針，實施人才強校戰略，集全校之力，揚比較優勢，謀跨越發展，促整體提高，不斷抓住新機遇，迎接新挑戰，構筑新優勢，贏得新發展，創造新輝煌。為創建國際知名的，以藥學為特色，理、工、經、管、文等學科協調發展的多科性、研究型大學而努力奮斗。