是進口糧食占國內生產的11%以上，遠遠超出中國1996年提出的95%糧食自給率的判斷，有可能影響中國糧食生產總水平，這要求中國重新評估國家糧食安全政策目標。二是在當前國內糧食供需緊平衡、高價位的背景下，糧食進口將打壓國內價格，直接損害種糧農民利益，不利于國內糧食增產。三是影響政府各項支農政策效應的發揮，尤其會抵消現有糧食扶持政策的積極作用。2006年中國取消植物油進口關稅配額管理，對國內大豆、油菜籽、花生等的生產和加工行業的影響也不可低估。
第二，農產品貿易逆差可能成為常態。過渡期三年來，大豆進口增長較快，配額農產品如棉花、食糖、羊毛、棕櫚油等進口較多，配額使用率較高(20-70%不等)，今后進口仍將呈擴大趨勢。2004年中國農產品進口280.3億美元(比2003年同期增長48.1%)，出口233.9億美元(同比增長9.2%)，逆差46.4億美元(海關總署，2005)。根據中國農產品供需結構和農業資源稟賦特征，我們初步判斷，今后中國農業的進口貿易依存度將進一步提高，農產品貿易將呈大進大出趨勢，貿易逆差有可能成為常態，這是今后影響國際收支平衡的一個潛在因素。
第三，國際市場風險防范和管理的難度加大。隨著各個領域全面對外開放，中國將面臨越來越多的國際市場風險挑戰，防范和化解的難度日益增大。國際農產品市場風險尤為復雜。如2004年4月底國際大豆市場價格急劇波動，市場風險通過跨國公司的營銷鏈條迅速傳遞到國內市場，導致國內大豆壓榨企業全面虧損，初步估計損失達50億元。
第四，國際農產品貿易環境日趨復雜。中國將進入貿易摩擦高發期。技術性貿易壁壘、反傾銷、特殊保障條款 等將成為今后中國農產品出口的主要壁壘，“輿論壁壘” 等新型壁壘也呈上升之勢。發達國家繼續對農業提供巨額補貼，國際農產品貿易被嚴重扭曲，多哈談判建立國際農業貿易新規則和新秩序步履維艱。這都將在今后一個時期影響中國發揮比較優勢，擴大優勢農產品出口。
第五，從戰略上看，在加入WTO背景下，中國農業所面臨的挑戰，其實并不在于農產品進口數量的可能增加，更尖銳的矛盾，主要在于農村人口尚未大規模轉移背景下，進口農產品增加后大量農民的就業和收入問題。這是一個在很大程度上決定和影響著中國經濟改革、發展和社會穩定的全局性問題。有學者指出，如果對經濟發展只注重國內生產總值和財政收入的增長速度，往往會將農業看成是對國內生產總值和財政收入增長無足輕重的部門，因此不愿意增加政府對農業發展的支持和保護，這顯然不利于提高中國農業國際競爭力。在發達國家高額補貼的農產品進口沖擊下，中國不少地區的農業和農村經濟就可能面臨衰落的危險。這樣，受威脅的可能并不是國內農產品的供求平衡，而是引起的相當數量的農民的就業和收入問題(陳錫文，2004)。
三、今后的挑戰與關鍵問題
20世紀90年代后期以來，中國農業發展進入新階段，農產品供求關系發生重大變化，實現了由長期短缺到總量基本平衡、豐年有余的歷史性轉變。收入水平的提高、消費需求結構的顯著變化，對農產品從主要是數量需求轉向數量、質量雙重需求；農業發展從過去主要受資源約束轉向受資源、市場雙重約束。2001年底中國加入WTO，則把中國農業融入全球經濟一體化進程，必須面對國內市場與國際市場競爭的雙重挑戰。中國農業發展的環境和條件發生了深刻而重大的變化。
而從現在起的今后若干年，中國正處在人均GDP從1000美元到3000美元的發展新階段，將進入工業化、城鎮化和現代化加速發展的重要時期。國際經驗表明，這既是中國發展的戰略機遇期，也是各類矛盾凸現的挑戰期。在這一關鍵時期，著力解決好“三農”問題，繼續發揮農業農村經濟對國民經濟的支撐作用，不僅關系到農民增收、農業增效和農村發展，而且直接影響中國對戰略機遇的把握，事關國民經濟和社會發展大局。但是，中國農業目前仍然是國民經濟最薄弱的環節，一些長期困擾農業和農村經濟發展的深層次矛盾還遠沒有根本解決，在可以預見的將來，中國作為一個發展中的農業大國，農業發展將面臨越來越多的壓力和挑戰，比較突出的有：
1.人口和食物消費需求增長的壓力與日俱增。2004年底中國人口為13億，預計到2010年達到13.45億。按照目前的糧食消費結構和需求總量測算，到2010年，糧食年需求量至少為5億噸。目前中國的糧食生產能力4.7億噸，要想在今后5年內使農業恢復到5億噸的生產能力，在物質和技術條件上都存在較大的難度。如何保障13-14億人口的糧食安全問題，是今后中國農業不能回避的戰略問題。
2.農業資源剛性約束矛盾日益突出。人多地少是中國的基本國情。目前中國人均耕地面積不足1.5畝，僅為世界平均水平的43%。從長期看，人口增加、耕地減少，耕地資源緊張的矛盾將始終存在。人均水資源也僅為世界平均水平的1/4，干旱和嚴重缺水已經成為制約西北、華北和中部地區農業發展的瓶頸。今后農業資源緊張的矛盾對農業發展的約束將越來越突出，直接威脅中國的糧食安全和農產品供給。
3.農業國際競爭力在短期內難以提高。中國農業在技術進步、產品質量和整體競爭力與主要農產品貿易國的差距在短期內難以改變，中國小規模分散經營的傳統農業與國外大規模現代化農業難以競爭的局面，在較長時期內也不會出現逆轉。在今后相當長的一段時期內，中國農業投資投入不足，農村資金短缺，生產要素持續外流，農產品市場體系、農業社會化服務體系和國家對農業的支持政策體系不完善等問題將難以在根本上改變，因此在短期內進一步提高中國農業競爭力的難度較大。這也決定了在世界貿易體系中，中國農業必須充分發揮自身優勢，選擇正確的發展戰略。
4.影響農業和農村發展的體制性制度性矛盾開始凸現。在城鎮化和工業化加速發展的背景下，長期積累的城鄉二元結構中的一些深層矛盾開始顯現：城鄉居民的收入水平、享受公共服務和社會保障等方面的差距進一步拉大，農村與城市的面貌反差強烈；城鄉之間各種要素合理流動的市場體系還沒有形成，影響農村勞動力轉移的體制性障礙仍然存在，農民就業增收渠道難以拓寬。從根本上改變影響中國農業農村發展的城鄉二元結構，還需要一個長期的過程。
未完以下網站有全文。
對外貿易經濟合作部關于關于下達2002年度部分農產品出口配額有關問題的通知 外經貿貿農函[2001]第826號 各省、自治區、直轄市及計劃單列市外經貿廳（委、局），各有關中央管理的外經貿企業： 根據外經貿部關于出口商品配額管理的有關規定，參照國際市場供需情況及各地區、各企業2001年1－10月出口配額執行情況。
有關事項通知如下：
一、自2002年1月1日起，板栗、葦簾、紅小豆、蜂蜜、松香、大蒜（對韓國以外市場）、桐木及板材（對日本）、雞肉（對港澳）、豬肉（對港澳）、牛肉（對港澳）不再實行出口配額管理。 2002年實行出口配額管理的農產品品種為：大米、玉米、小麥、棉花、食糖、茶葉、鋸材、藺草及其制品、大蒜（對韓國）、活豬（對港澳）、活牛（對港澳）、活雞（對港澳），共12種。其中，藺草及其制品、大蒜（對韓國）出口配額實行招標。
二、2002年部分農產品出口配額分配方案見附表1，2002年農產品邊境貿易出口配額分配。
三、除邊境貿易出口配額外，大米、玉米、小麥、棉花、食糖等5種農產品的出口配額另行下達。
四、為確保供港鮮活商品質量，外經貿部決定以供港活雞為試點，加大對生產企業自營出口的扶持力度，進一步推動外貿流通企業向實業化方向發展，擬將2002年度配額總量的10%（約330萬只）用于專項扶持生產企業出口。具體資格條件、申報程序、管理辦法等另行通知。
五、2002年起，供港澳鮮活商品出現違規或質量問題的，不僅扣減月度配額，還將扣減年度配額基數，用于扶持生產企業。
六、2002年起，供港澳地區雞肉、豬肉、牛肉不再審批出口經營資格，不再指定代理。 七、2002年起，取消供港澳活塘魚出口配額放行證管理。
八、各地外經貿主管部門應嚴格按照外經貿部出口配額和出口指定經營管理的有關規定，做好出口配額的二次分配和核查、反饋工作，配額應重點分配給配額使用率高、經營能力強的企業。
各地配額二次分配方案應于2002年1月15日前報外經貿部（外貿司）審核備案，同時抄送外經貿部配額許可證事務局、中國國際電子商務中心和有關出口許可證發證機構。 特此通知。