首先，這是兩個不同性質的公司。
1、報關行是專門負責報關業務的單位，代理外貿公司和工廠報關。并且只能在注冊地報關，如要在別的口岸報關需要設分支機構。
2、外貿公司是指有對外貿易經營資格的貿易公司，它的業務往來重點在國外，通過市場的調研，把國外商品進口到國內來銷售，或者收購國內商品銷售到國外，從中賺取差價。
外貿公司做一些沒有進出口權單位的進出口代理，收取代理費。
簡單點理解，報關行只是申報單位，沒有貿易行為；外貿公司有貿易行為，但是無權向海關申報。
兩者的差別是很大的
進出口代理公司擁有進出口權，可以代理進口或者出口
報關行只是負責貨物的出口報關和進口清關
現在有些綜合性的物流公司集貿易代理、物流、報關于一身，并在全國多個口岸設立分公司，比如建發物流
進出口公司有進出口經營權，可以以他們的名義代理別家無進出口經營權的企業進出口貨物。
（無進出口經營權的企業無權直接進出口貨物）
報關企業無進出口經營權，只能代理其他企業的進出口報關。
法律主觀：
貿易公司一般是指專門從事貨物和勞務交易的公司。其經營范圍由公司章程規定，并依法登記，一般包括購買、銷售等經營活動。貿易公司從事商業活動時，其主要職能是開具發票。
法律客觀：《對外貿易經營者備案登記辦法》
第二條
從事貨物進出口或者技術進出口的對外貿易經營者，應當向中華人民共和國商務部（以下簡稱商務部）或商務部委托的機構辦理備案登記；
但是，法律、行政法規和商務部規定不需要備案登記的除外。對外貿易經營者未按照本辦法辦理備案登記的，海關不予辦理進出口的報關驗放手續。
《中華人民共和國公司法》
第七條
依法設立的公司，由公司登記機關發給公司營業執照。公司營業執照簽發日期為公司成立日期。公司營業執照應當載明公司的名稱、住所、注冊資本、經營范圍、法定代表人姓名等事項。公司營業執照記載的事項發生變更的，公司應當依法辦理變更登記，由公司登記機關換發營業執照。
1、意思不同
貿易公司一般指從事貨物和勞務交易的公司。其業務范圍包括購買、銷售和其他如進行營業活動，也可以用經紀人或代理商身份從事活動。但貿易公司不論采用哪一種方式從事業務活動，其職能都只是開發票。
外貿公司是指有對外貿易經營資格的貿易公司，它的業務往來重點在國外，通過市場的調研，把國外商品進口到國內來銷售，或者收購國內商品銷售到國外，從中賺取差價。
2、范圍不同
外貿公司主要是做進出口的，他們是需要有進出口權。而貿易公司，如果是是國內的貿易的話，可以沒有進出口權，如果是國際貿易的話一般會在公司名稱上注明的，營業執照上有經營范圍的，他們也是需要有進出口權的。