首先，成本低：傳統的跨境貿易大部分主要由一國的進/出口商通過另一國的出/進口商集中進/出口大批量貨物，然后通過境內流通企業經過多級分銷，最后到達有需求的企業或消費者。進出口環節多、時間長、成本高，而跨境電商的出現，直面最終消費者，大大降低了企業走出國門的成本。
其次，速度快：只要海外采購商在平臺上下訂單，強大的物流體系可以使貨品在1-2周內就可以到達買家手中。
最后，易上手：只要商家客戶通過跨境電商平臺就可以方便的購物交易。
通關效率低。通關效率低。所謂傳統貿易一般是指貨物貿易，通常具有批量大、周期長、頻率低的特點。而電子商務的供應商與客戶是直接見面的，這種變化會引發整個跨境貿易電子商務產業鏈或者環節上的變化。所以單個客戶商與單個客戶之間批量就很小，相對應的頻率也發生變化，由過去的低頻變成高頻。這樣的頻率變換降低了通關效率，對海關的監管提出了新的挑戰。
跨境貿易電子商務在交易的過程中不可避免的會涉及到海關通關監管與征稅。大量的貨物通過快件渠道和郵遞渠道進境，對海關的監管方式與征稅帶來了更高的要求。而面對跨境貨物的郵遞與退換等問題，現行的海關監管模式仍不能很好地解決。一些電子商務企業在跨境貿易方面已經出現了一些問題，特別是難以快速通關與規范結匯。因此，相關企業和社會迫切期待海關進一步提高通關效率。
通關效率低。所謂傳統貿易一般是指貨物貿易，通常具有批量大、周期長、頻率低的特點。而電子商務的供應商與客戶是直接見面的，這種變化會引發整個跨境貿易電子商務產業鏈或者環節上的變化。所以單個客戶商與單個客戶之間批量就很小，相對應的頻率也發生變化，由過去的低頻變成高頻。這樣的頻率變換降低了通關效率，對海關的監管提出了新的挑戰。
跨境貿易電子商務在交易的過程中不可避免的會涉及到海關通關監管與征稅。大量的貨物通過快件渠道和郵遞渠道進境，對海關的監管方式與征稅帶來了更高的要求。而面對跨境貨物的郵遞與退換等問題，現行的海關監管模式仍不能很好地解決。一些電子商務企業在跨境貿易方面已經出現了一些問題，特別是難以快速通關與規范結匯。因此，相關企業和社會迫切期待海關進一步提高通關效率。
退稅問題。我國現今的稅收制度在電子商務方面還不完善，而當下的誰該也在考慮這方面的問題。
一、易受國際進口貿易保護者的抵制。隨著跨境電商海外倉的建設，大批量商品的進口對本國傳統商業帶來影響，使得利益相關者產生抵制傾向，加之我國商品在知識產權、產品安全等方面的諸多缺陷，面臨的貿易糾紛更加頻繁。
二、海外倉構建下企業需要負責外貿、貨物清關等諸多事項，由于傳統目的地國的進口貿易由海外進口商完成，但對于海外倉物流配送模式，這些手續由跨境電商自負辦理。同時，在清關方式上，傳統小包由郵政來完成，而對于海外倉批量發貨，走大宗貨物清關方式，要求更嚴格，認證體系更繁瑣。
三、對跨境電商的管理、服務能力要求更高。從海外倉經營管理過程來看，貨物交由海外倉運營主體來進行管理，并負責倉儲、物流、配送業務，由此需要對貨物進行快捷、準確、實時化管理，所需的信息技術水平更高。
跨境電商海外倉的發展，還面臨諸多阻力。我們要從各個方面來發揮海外倉優勢，逐一破解劣勢難題，不斷構建以滿足海內外消費者良好的購物體驗的海外倉模式。
這是不可能的
大批量的國際貿易商品還必須通過正常的外貿渠道在國際市場上流通
且不說小商品和電子產品，這都是可以在跨境貿易中交易的
但是鋼材，煤炭，礦石，石油，木材，糧食等，這些交易的貨物量都是巨量的
例如從美國進口大豆的一次的運載量，需要使用10萬噸級的散貨船運輸，跨境電商或許一年也不一定能交易這么多的商品
1
對經營主體的影響 在跨境電商領域，經營主體已經發生了改變
因為跨境電商是利用互聯網技術開展貿易的，“虛擬企業”就成為跨境電商的經營主體形式，其通過互聯網平臺來為客戶提供跨境電商貿易服務
此外，另一種跨境電商經營主體形式是“虛擬企業”+貿易企業，其能為客戶提供更豐富的服務，較好地契合了跨境電子商務的發展需求
2
對交易方式的影響 從交易方式來看，傳統國際貿易采用的是面談協商或者電話協商的交易方式，這種交易方式成本高，交易效率低，還極易發生誤差
跨境電商因是利用互聯網進行交易的，交易方式更加方便、便捷和高效
互聯網是無國界的，不受地域和時間的影響，利用互聯網通信，交易雙方可以達到類似即時面對面交易的效果
這不僅極大地降低了傳統國際貿易的成本，也在很大程度上實現了“零庫存”交易
3
對經營與營銷模式的影響 傳統國際貿易采用的是“企業進口商品--企業銷售商品”的經營與營銷模式，在這種模式下，消費者處于弱勢地位，企業處于絕對強勢地位，消費者很難對商品進行自主選擇權
跨境電商使得廣大消費者可以直接對話國外商家，能從網上自主挑選所需商品，還可對商品進行私人定制
傳統國際貿易交易過程中，涉及的中間環節比較多，需要眾多的部門和人員參與，如果在任何一個環節出現問題，都可能會直接影響到整筆貿易的順利開展
跨境電商則不需要很多環節和人員，提高了貿易的效率
更重要的是，在這個虛擬市場上，有眾多的商家和商機，信息流、資金流及業務流集成一體，貿易雙方只要有電腦和網絡，就可以快速地完成談判、看貨、下單、租船、訂艙、報檢、報關等工作，極大地降低了人、財、物等資源的投入，也縮短了制單結匯的時間，降低了國際貿易的成本
4
對國際貿易監管的影響 跨境電商通過計算機和互聯網進行交易，這種交易方式是對傳統國際貿易交易形式的創新，同時，也直接導致傳統國際貿易管理模式的變革
跨境電商因其交易環節與流程得到簡化，因而國際貿易管理模式也相應地也得到了簡化，這有助于提高國際貿易的服務效率與質量，能推動國際貿易實現可持續發展
跨境電商具有“網絡化”、“全球化”特征，在跨境電商運作模式下，處在不同國家的交易雙方通過網絡平臺進行貿易，加大了稅務監管部門管理的難度
如果繼續沿用傳統國際貿易的監管模式，將無法對國際貿易行為進行監管，因此，必須要改革國際貿易監督模式，立足實際建立健全各項管理制度，這樣才能確保跨境電商和國際貿易交易安全，規范商家、消費者等的行為