制度創新是自由貿易試驗區建設的核心。廣東、天津、福建自由貿易試驗區運行以來，形成了一批可復制可推廣的創新成果，包括國際貿易“單一窗口”、企業專屬網頁政務服務新模式、以信用風險分類為依托的市場監管制度、投資管理體制改革“四個一”、企業簡易注銷等改革試點，這些制度創新經驗已經向全國復制推廣并逐步釋放改革開放的紅利。
黨的十九大報告強調：“賦予自由貿易試驗區更大改革自主權。”為此，《深化方案》在制度創新方面繼續深入挖掘潛力，加大改革力度。在準入規則方面，進一步擴大投資準入，完善外商投資準入前國民待遇和負面清單的管理制度；在貿易便利化規則方面，進一步提升便利化水平，加快建設“單一窗口”、“一站式作業”等；在監管規則方面，轉變政府職能，推進審批流程優化，深化事中事后監管體制，以互聯網等技術手段創新綜合監管模式等。
《深化方案》通過與國際貿易投資規則相銜接，加快形成法治化、國際化、便利化的營商環境，打造開放型經濟創新區、示范區。來源：央視網
建設先行示范區的四大中心體系包括：
1、提升金融總部集聚區功能，著力打造更具競爭力的區域性“國際金融中心”。
2、提升深港創新融合發展引擎功能，著力打造更具輻射力的“科技創新中心”。
3、提升人文高地功能，著力打造更具軟實力的“文化教育中心”。
4、提升城市會客廳功能，著力打造更具影響力的“服務交流中心”。
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賦予自由貿易試驗區更大改革自主權，探索建設自由貿易港。
黨的十九大報告提出推動形成全面開放新格局，要求以“一帶一路”建設為重點，堅持引進來和走出去并重，遵循共商共建共享原則，加強創新能力開放合作，形成陸海內外聯動、東西雙向互濟的開放格局。在開放平臺建設方面，明確賦予自由貿易試驗區更大改革自主權，首次提出探索建設自由貿易港，這標志著我國對外開放程度將進一步加大，會以更加開放的心態，迎接全球化和貿易投資自由化。
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法律分析：海南全島建設自由貿易試驗區，要以制度創新為核心，賦予更大改革自主權，支持海南大膽試、大膽闖、自主改，加快形成法治化、國際化、便利化的營商環境和公平開放統一高效的市場環境。 要更大力度轉變政府職能，深化簡政放權、放管結合、優化服務改革，全面提升政府治理能力。
法律依據：《中華人民共和國城鄉規劃法》
第二十八條 地方各級人民政府應當根據當地經濟社會發展水平，量力而行，尊重群眾意愿，有計劃、分步驟地組織實施城鄉規劃。
第二十九條 城市的建設和發展，應當優先安排基礎設施以及公共服務設施的建設，妥善處理新區開發與舊區改建的關系，統籌兼顧進城務工人員生活和周邊農村經濟社會發展、村民生產與生活的需要。
鎮的建設和發展，應當結合農村經濟社會發展和產業結構調整，優先安排供水、排水、供電、供氣、道路、通信、廣播電視等基礎設施和學校、衛生院、文化站、幼兒園、福利院等公共服務設施的建設，為周邊農村提供服務。
鄉、村莊的建設和發展，應當因地制宜、節約用地，發揮村民自治組織的作用，引導村民合理進行建設，改善農村生產、生活條件。
第三十條 城市新區的開發和建設，應當合理確定建設規模和時序，充分利用現有市政基礎設施和公共服務設施，嚴格保護自然資源和生態環境，體現地方特色。
在城市總體規劃、鎮總體規劃確定的建設用地范圍以外，不得設立各類開發區和城市新區。
第三十一條 舊城區的改建，應當保護歷史文化遺產和傳統風貌，合理確定拆遷和建設規模，有計劃地對危房集中、基礎設施落后等地段進行改建。
自由貿易區是指在貿易和投資等方面比世貿組織有關規定更加優惠的貿易安排區域。
在主權國家或地區的關境以外，劃出特定的區域，準許外國商品豁免關稅自由進出。
實質上是采取自由港政策的關稅隔離區。狹義僅指提供區內加工出口所需原料等貨物的進口豁免關稅的地區，類似出口加工區。
所以自由貿易試驗區就是實行自由貿易的實驗區。