黃定九——上海交通大學附屬仁濟醫院教授，博士生導師，仁濟醫院心內科主任，享受國務院特殊津貼，對心血管疾病具有豐富的臨床經驗。（專家門診服務臺預約）
陸廣華——上海交通大學附屬仁濟醫院教授。主治內分泌代謝性疾病，主要對糖尿病及其并發癥，以及甲狀腺疾病的診斷與治療，具有豐富的臨床經驗。（周四上午專家門診）
張效禹——上海中醫藥大學教授。擅治腫瘤，肝病及其他免疫性疾病，對腫瘤晚期，廣泛轉移，術后復發者，均可達到減輕痛苦之目的。（周五下午專家門診）
李國梁——上海交通大學附屬第九人民醫院口腔科副主任，擅長牙體，牙髓，根尖等疾病和牙外科的診斷與治療。（周二下午專家門診）
華佩炎——上海交通大學附屬新華醫院眼科主任醫師，對各類白內障的處理有一定特色，擅長超聲乳化白內障等顯微手術及YAG激光治療。（專家門診服務臺預約） 韓淑珍——內三科主任，內科主任醫師。現任公惠醫院ICU，心血管科主任，從事老年病科心血管疾病的診斷和治療，擅長老年病及心血管疾病的診斷和治療。（周二上午專家門診）
顧琴財——內科主任醫師。對糖尿病，心血管系統疾病具有豐富的臨床經驗，擅長糖尿病，高血壓，心腦血管疾病的診斷和治療。（周五上午專家門診）
祝永峰——中醫科主任，中醫內科副主任醫師。現任公惠醫院中醫科主任，對頸椎病，頸突癥，腰突癥等用中醫綜合治療頗有心得，用中醫藥為主治療骨質疏松癥，中風后遺癥，慢性泄瀉，脂肪肝，腫瘤手術后康復，并取得了一定的療效。（周三上午專家門診）
沈祖佑——內四科主任，副主任醫師。現任神經內科病房主任，擅長腦血管疾病，心血管疾病的診斷和治療。（周四上午專家門診）
趙輝——公惠醫院副院長，外科副主任醫師。擅長各科普外手術，腹壁疝，膽道疾病，肛痔疾病的診斷和治療。（周二下午專家門診）
王云芳——骨科副主任醫師。擅長對腰腿疼的診斷，治療及特殊類型的腰椎間盤突出癥的手術治療。（周一上午專家門診）
醫院設有52個臨床醫技科室：消化科、心內科、風濕病科、核醫學科、婦產科、婦科腫瘤科、泌尿科、腎臟科、麻醉科、疼痛科、重癥醫學科、放射科、胃腸外科、肝臟外科、膽胰外科、乳腺外科、血管外科、頭頸外科、血液科、老年病科、超聲醫學科、神經內科、內分泌科、骨科、呼吸科、耳鼻咽喉科、整形外科、眼科、生殖醫學科、放射診療科、藥劑科、健康保健中心、輸血科、檢驗科、兒科、康復科、口腔科、皮膚科、腫瘤科、急診科、胸外科、心血管外科、病理科、中醫科、營養科、內科門診、感染科、腫瘤介入科、功能神經外科、變態反應科（過敏科）、臨床干細胞中心、中心實驗室、生物樣本庫。 風濕病科
感染科
呼吸科
急診科
老年病科
內分泌科
內科門診科
神經內科
腎臟科
消化科
心內科
血液科 膽胰外科
肝臟外科
功能神經科
骨科
麻醉科
泌尿科
乳腺外科
神經外科
疼痛科
頭頸外科
胃腸外科
心血管外科
胸外科
血管外科
整形外科
腫瘤介入科 婦產科
婦科
腫瘤科 耳鼻咽喉科
放療科
過敏科
健康保健科
康復科
口腔科
臨床營養科
皮膚科
生殖醫學科
特需中心
眼科
中醫科
腫瘤科
重癥醫學科 病理科
超聲醫學科
放射科
干細胞實驗室
核醫學科
檢驗科
生物樣本庫
輸血科
藥劑科
中心實驗室
復旦大學附屬
中山醫院：擅長肝癌的綜合治療、心血管病、呼吸內科，尤其是肝移植全國領先。
華山醫院：以神經外科、神經內科、皮膚科、骨科（尤其是手外科）為特長，江蘇路分部是乳腺專科。
華東醫院：老年病特色。
復旦大學附屬兒科醫院：主體已搬到閔行區顧戴路，小兒外科國內知名，分離過多例連體嬰兒。
復旦大學附屬腫瘤醫院：腫瘤科、病理科滬上領先。
復旦大學附屬眼耳鼻喉科醫院（五官科醫院）：眼科、眼視光、眼外傷、耳鼻喉各種疾病。
復旦大學附屬婦產科醫院（紅房子醫院）：不孕不育。
復旦大學附屬公共衛生臨床中心：原來的上海市傳染病醫院，收治各種法定傳染病。
上海交通大學醫學院附屬
瑞金醫院：血液科、燒傷科、內分泌科最強，腎臟科、消化科、感染科也在滬上前列。
仁濟醫院：以消化內科、風濕免疫科、神經外科、婦產科見長，也是上海人類精子庫所在地。
新華醫院：綜合性醫院，但兒科名揚全國，小兒心血管、小兒血液、小兒外科等在全國一流，水平遠高于兒童專科醫院。成人方面，心血管、消化、神經內科為重點學科。
上海兒童醫學中心：新華醫院下屬的兒童專科醫院，擅長兒童先天性心臟病手術。
上海交大附屬上海市兒童醫院：靜安區北京西路，在普陀區建有新院，遺傳病、小兒泌尿較有優勢。
上海市第一人民醫院：眼科、眼底病、中醫消化病、泌尿外科、心外科、器官移植處于前列。
上海市第六人民醫院：在糖尿病、斷肢再植（骨顯微外科）、超聲醫學等領域名揚全國。
上海市第九人民醫院：以口腔科、整復外科、關節外科為重點，是整形領域的領頭羊。
上海交大附屬上海市胸科醫院，徐家匯附近，在肺癌、心肺功能障礙、胸部積水等方面實力強。
上海市精神衛生中心：下屬上海市心理買粉絲中心，精神疾病、心理買粉絲等方面實力不錯。
國際和平婦幼保健院：徐家匯衡山路，開展試管嬰兒，不孕不育、婦女保健較強。
上海中醫藥大學附屬
龍華醫院：擅長中醫治療惡性腫瘤、骨退行性病變、腎病、風濕病、乳腺病、脾胃病、呼吸病等，其中以中醫外科和中醫腫瘤最為出名。
曙光醫院：盧灣和浦東張江都有，擅長中醫肝病、骨傷科、中醫腎病、糖尿病、脾胃病。
岳陽中西醫結合醫院：針灸推拿、中醫婦科、中醫血液科比較好。
市中醫醫院，位于閘北區芷江中路，中醫兒科、中醫失眠癥、中醫紅斑狼瘡等有特色。
第二軍醫大學附屬
長海醫院：楊浦區長海路，形成肝膽外科、胸心外科、燒傷外科、血管外科、血液內科、消化內科等特色學科。
長征醫院：頸椎病、脊柱病的手術（脊柱外科）全國有名，形成骨科、神經外科、器官移植、腎病、皮膚真菌病、多發傷救治等特色。
東方肝膽外科醫院：肝臟腫瘤、介入治療，復雜膽道手術以及肝移植等方面居國內先進水平。
同濟大學附屬
同濟醫院：原名甘泉醫院，并入同濟大學后才得以真正發展，心內科、精神醫學科稍好。
上海市肺科醫院：肺移植技術熟練，在職業病、肺部腫瘤、肺氣腫等領域領先。
同濟大學口腔醫院：上海唯一三甲口腔醫院，但不如九院的口腔科名氣大。
上海市第十人民醫院：中醫心腦血管病、視覺復明、創傷急救處于上海市內領先地位。
同濟大學附屬第一婦嬰保健院：產前診斷、圍產醫學較強。
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