逐漸完善，但其較為嚴格的假設前提仍然導致了解釋力的局限性。首先，該理論沒有充分考慮產品差異性，產品的差異不僅體現在產品的功用上，還體現在技術含量、功能多樣性、質量、檔次等方面，現代企業越來越重視產品差異化和市場細分，將市場分為高端和低端，一些企業的產品主要銷往高端市場，而一些企業產品銷往低端市場，新新貿易理論還不能解釋如技術含量等差異帶來的產業內貿易現象。其次，新新貿易理論還有待引入企業異質性的其他內涵，企業異質性不僅體現在生產率、企業規模、組織結構等方面，還體現在跨國經營方式(出口、FDI、獨資、合資等)、企業戰略、市場定位等方面。第三，沒有考慮家庭和企業的動態最優化決策，新新貿易理論的均衡是一般均衡分析法下得到的結果，沒有考慮家庭和廠商的動態最優化均衡。

新新貿易理論從企業的異質性入手說明了貿易的好處，蘊涵著豐富的政策含義：(1)對于落后的國家和地區來講，應積極參與國際國內分工，提高對外開放水平，這有利于提高行業生產率水平，充分發揮優勝劣汰效應。因此，無論是作為中央政府，還是地方政府，推動出口導向和對外開放政策都非常重要，將有利于本地的經濟發展。(2)新新貿易理論找到了一條提高生產率的新路徑，在不提高單個企業生產率水平的情況下，一國仍然可以通過貿易和開放來提高一個產業甚至全國的生產率水平。

但是，新新貿易理論也表明，自由貿易可能給落后地區帶來負面的沖擊和影響：(1)市場開放可能對落后地區某些產業的發展帶來不利影響，例如，一些技術含量高但對地區未來經濟發展卻頗為關鍵的產業，可能由于外部高效率企業的進入而衰退，所以在引進外部企業的同時，還應考慮這些企業對本地區相關產業的帶動效應。(2)自由貿易導致了資源的重新配置，使利潤和市場份額向高生產率企業轉移，這可能導致資源過度壟斷而造成整體市場效率的損失。(3)如果貿易僅發生在部分地區，這可能會拉大地區內部的差距，固化地區分工。如我國的沿海和內地，由于受區位等因素的影響，沿海企業更易獲得貿易帶來的好處，而內地企業則更傾向于滿足國內市場，這也是地區差距形成的重要原因。