策適用不夠公平。在稅收政策上，國有企業可先繳后退，非國有企業無此待遇；中小企業特別是個私企業往往是小額納稅人，增值稅發票難以抵扣，實際稅負增加；個私企業存在雙重納稅等。在士地政策上，國有企業可享受土地使用權出讓金、增值稅減免政策，而非國有企業無此改革成本參與改組；特別是在銀行呆壞帳準備金核銷上，大企業可列入國家計劃及時優化資產負債結構，中小企業無此厚遇。在行業準入上，中小企業尤其是個私企業還受到諸多限制。此外，市場交易規則缺乏，市場秩序混亂，致使中小企業正常經營困難重重。
----(三)融資困難，告貸無門。一是供應不足。我國尚無專門為中小企業貸款的金融機構。加之商業銀行體制改革后權利上收，以中小企業為放貸對象的基層銀行有責無權，有心無力；實行資產負債比例管理后，逐級下達“存貸比例”，使本來就少的貸款數量更為可憐，貸款供應缺口加大。二是保證缺乏。銀行只認可土地房產等不動產作抵押，中小企業擔保機構少，擔保品種單一，尋保難。三是輔導薄弱。中小企業貸款難、尋保難與其資信等級不夠有關。建立以企業資信檔案為基礎的信用制度已迫在眉捷。此外，中小企業借貸成本高，也影響了其融資能力。基于上述原因，福建省中小企業約有52％無力從銀行獲得貨款，致使 21.6％的中型企業開工率不足50％；73％的小型企業開工率低于80％。
----(四)產權不清 ，缺乏動力
----由于政策不公、行業限制，個私企業戴“紅帽子”(集體、鄉鎮企業)穿“洋外衣”(三資企業)現象普遍。據調查，上海市“假集體”占全市集體企業的20％左右，泉州市鄉鎮企業中有相當部分為個私企業。由于產權不清，一些中小企業發展到一定程度就不愿做大，企業的進一步發展受到人為限制。
----除上述企業的外部問題外，就中小企業自身而言，主要是存在企業體制和組織制度不適應經濟發展的需要、管理水平和人員素質不適應經濟發展的需要、管理水平和人員素質有待提高 、技術含量不高開發能力不強、盲目投資及低水平重復建設嚴重等問題。促進中小企業發展的現行政策
----目前實行的一些優惠政策，雖大部分并不是專為中小企業制定的，但從受益主體來看，基本上或相當大部分是中小企業。
----1.鄉鎮企業政策。鄉鎮企業所提稅可按應繳銳款減征10％，用于補助社會性開支，不再稅前提取10％；國家在信款上重點支持鄉鎮企業的出口創匯、東西部合作和農村適用技術轉讓(星火計劃項目)三個方面。
----2.鼓勵安置城鎮待業人員就業政策。新辦法城鎮勞動就業服務企業，當年待業人員超過企業從業人員總數60％的，經主管稅務機關審查批準，可免征所得稅3年；免稅期滿后，當年新安置待業人員占企業原從業人員總數30％以上的，經主管稅務機關審核批準，可減半征收所得稅2年。
----3.支持高新技術企業政策。國務院批準的高新技術產業開發區內企業，經有關部門認定為高新技術企業的，可按15％的稅率征收所得稅；國務院批準的高新技術產業開發區內新辦的高新技術企業，自投產后年度起征所得稅2年。企事業單位進行技術轉讓脫離技術轉讓及發生的相關技術買粉絲、服務、培訓所得，年凈收入在30萬元以下的，免征所得稅。
----4.支持貧因地區發展改革政策。國家確定的“老、少、邊、窮”地區新辦企業，經主管稅務機關批準后，可減征或免征所得稅3年；民族自治地方企業，需照顧鼓勵的，經省政府批準，可定期減征或免征所得稅3年。
----5.支持和鼓勵第三產業政策。1)為農業生產的行業企業，其提供的技術服務或勞務所得免征所得稅；2)科研單位和大專院校技術成果轉讓、技術培訓、技術買粉絲、技術服務、技術承包取得的技術性服務收入免征所得稅；3)新辦獨立核算的買粉絲、信息、技術服務企業或單位，開業之日起，第一至二年免征所得稅；4)新辦獨立核算的交通運輸、郵電通信企業或單位，自開業之日起，第一年免征所得稅，第二年減半征收所得銳；5)新辦獨立核算的公用事業、商業、物資、外貿、旅游、倉儲、居民服務、飲食、文教衛生企業或單位，自開業之日起，報經主管稅務機關批準，可減征或免征所得稅1年。
----6.福利企業政策。民政部門舉辦的福利生產企業可減征或免征所得稅；安置“四殘”(盲、聾、啞和肢體殘疾)人員占生產人員總數的35％以上免征所得稅；安置“四殘”人員占生產人員總數超過10％不足35％，減半征收所得稅。
----7.小型企業所得稅政策。1994年稅制改革確定的企業所得稅稅率為33％的比例稅率。為照顧小型企業稅賦能力，對年利潤在3萬元以下企業，減按18％征收所得稅；3至10萬元企業，減按27％征收所得稅。1998年7月1日國務院決定，年銷售額180萬元以下的小型商業企業，增值稅率由 6％調減為4％。
（1）生產型外貿企業自營出口業務與流通型外貿企業自營出口業務相比，外貿業務員減少了簽訂內貿合同工作環節。
（2）生產型外貿企業自營進口業務與流通型外貿企業自營進口業務相比，外貿業務員的工作是一樣的。