票不再傳輸到審核系統。如果外貿企業把用于退稅的發票做了抵扣勾選，應按如下順序進行操作：

(1)能夠撤銷勾選或簽名確認的或能夠回退所屬期的就撤銷或回退所屬期并重新勾選退稅

(2)不能重新勾選的，可以開具紅字發票信息表并讓供貨商開具紅字發票沖減，然后重新開具發票，對于重新開具的發票做退稅勾選；

(3)如果上面2點都不能操作的，則向稅務局申請進項稅額轉出核實函。即向主管稅局稅源管理科申請進項稅額轉出核實，如果已經抵扣進項稅的應先轉岀。稅源管理科核實該發票未用于抵扣后，會將《增值稅扣稅憑證進項稅額轉出情況核實函》發送給出口退稅審核系統。企業申請退稅，稅局用該核實函進行出口退稅審核(在異地協作平臺中操作核實函，企業再申報退稅即可)