斷水平又提高了一步。同年改造原內科大樓（8號樓），使之成為有中央空調設施的病房大樓。醫院又投資400余萬元，建立了實驗研究中心，還在中國首家建立和開通了多媒體遠程醫療會診中心。
1996年新建放射治療樓，引進美國GE公司生產的新型直線買粉絲等放射治療設備，建立放射治療科。同年，陳中偉院士主持了世界第一例游離第二足趾再造拇指術手術成功。1997年擴建逸仙樓和心血管病研究所大樓。
1998年中國遭遇百年未遇的特大洪災，中山醫院組建由副院長王玉琦教授為隊長的抗洪救災醫療隊奔赴湖南災區救援。同年心研所大樓加層改造工程完工。1999年院內感染中心經市衛生局評審通過為上海市院內感染質量監控中心，并掛靠醫院。6月血管外科在國內首創“對動脈瘤患者實施腔內支架術治療”獲得成功。8月由血管外科和波士頓科學國際有限公司聯合創辦中山－波士頓腔內血管外科培訓中心。11月成立復旦大學血管外科研究所。同年醫院斥資6000萬元人民幣購置門診部以西的10畝地，籌建7.2萬平方米的門急診醫療綜合大樓。
2000年普外科和整形外科在國內率先開展“腺體置換方法”治療乳腺癌，取得良好治療效果。同年在國內首例機器人輔助冠狀動脈搭橋手術及機器人輔助后腹腔鏡腎囊腫切除手術獲得成功。同年建立高壓氧科室和乳腺疾病與健康研究中心。由陳灝珠、葛均波教授主持上海市心血管病研究所等主辦的“第一屆東方國際介入心臟病會議”召開。中國中西醫結合學會皮膚性病專業委員會掛靠中山醫院。
2001年購進斜土路1609號原上海泰康食品廠地塊，并且對原泰康食品廠的辦公樓進行改造，作為門急診醫療綜合樓建設期間門診部過渡臨時用房。完成門急診大樓地塊108戶人家動遷工作，拆除老門診樓。12月28日舉行門急診綜合大樓的奠基儀式。先后成立了上海市臨床營養研究中心、上海市影像醫學研究所、復旦大學器官移植中心以及中山睡眠呼吸障礙與鼾癥診治中心。在中國首先引進TPS計劃系統開展125I放射性粒子植入前列腺治療前列腺癌，取得良好療效。2003年3月，王玉琦教授任中山醫院院長。新班子以建成上海市標志性醫院為目標，以深化改革，機制創新為措施，堅持抓防治非典這件大事不松勁，抓經濟建設、醫、教、研、管理等工作這個中心不動搖，穩步推進醫院發展。
三月底遇到天災SARS，中山醫院作為市監測點，嚴格按上級指示，采取了思想、組織、場地和設備等方面的堅決措施。本著“一個不漏、一個不染、一個不倒”的工作目標，“嚴”字當頭、橫下一條心，共闖難關，全力做好“非典”防治重中之重的工作。先后建立務實的SARS防病工作例會制度。成立了上海市第一個發熱專病門診；急事急辦，用最快速度引進安裝了一臺x光DR成像系統；關閉院內招待所的所有房間，改為工作人員的隔離休息用房。加強全員培訓，對涉及8個科室五個梯隊的人員進行重點培訓。組建兩支由17位醫護人員參加的醫療隊，支援上海市傳染病醫院。經受住了嚴峻的考驗，鍛煉了一支隊伍，順利完成上級交給的任務。
為了嚴格管理，加快干部隊伍建設。建立“干部管理公示制”，讓科室主任在全院干部工作例會上展示對科室管理的情況。改變以往年度考核形式、方法和內容，實行公開述職、考評小組打分、職工參與的形式，用4個半天時間，分別對科主任、副處級干部和部門負責人共64位中層干部進行年度述職考核，促進了管理工作。積極儲備干部資源。成立醫務二處。建立回國人員學術交流制度。讓回國人員在醫院或者科室作專題匯報交流發言，便及時了解和掌握最新的國際動態。重視醫學教育評估工作。全院動員，積極參與，充分準備，醫學教育工作得到醫學評估專家的肯定和贊揚。
醫院成立了經濟管理委員會，建章立制，實行財務、設備、藥品和工程建設中物資采購、招標議標等規范化管理。完成藥劑、設備和器材的成本核算，基本實現了藥品實庫存網絡管理。把心內科等7個臨床科室作為成本核算試點，為全院推行成本核算打基礎。
先后完成中心供應室、營養廚房、雙層連廊一期工程和靜脈藥物配置中心建設工程；實施對急診有限的空間充分的“挖潛”和改造。增加急診醫療用房717 m2，增設急診留觀察床位90張；完成1號樓外科病房大樓的大修和10號樓醫生辦公室的改建工程；改造和完善無障礙設施工程；門急診醫療綜合大樓建設工程8月28日完成結構封頂；進行天馬山分院改造工程，順利完成分院中生產車間的搬遷和改建工程的奠基。
經過近七十年的發展，中山醫院總部占地面積109畝，建筑面積177800平方米，核定床位1272張，現有工作人員2200名，其中中國科學院和工程院士3位，正副高級職稱近360名，享受國務院頒發政府津貼的專家76名。門急診人數每年約110多萬人次，住院22000人次，其中40 %來自中國各地。中山醫院是“211工程”和“985”重點建設項目的單位。設有7個研究所，即上海市心血管病研究所、復旦大學肝癌研究所、上海市中西醫結合康復研究所、上海市影像醫學研究所、復旦大學核醫學研究所、復旦大學血管外科研究所、復旦大學呼吸病研究所。有31個臨床科室，有7個醫技科室，10個診治中心，3個上海市衛生局臨床專業質量控制中心。病毒性心臟病實驗室為衛生部重點實驗室。癌變與侵襲原理重點實驗室為教育部重點實驗室。國家重點學科有內科學（心血管病、腎病、傳染病）、神經病學、影像醫學與核醫學、外科學（普外科、骨科、泌尿外科、神經外科）、眼科學、耳鼻咽喉科學、腫瘤學和中西醫結合臨床。肝腫瘤科和心內科是上海市領先學科和上海市臨床醫學中心，肺科為衛生部重點建設學科，麻醉科為上海市領先學科。
孫益紅。根據查詢醫療百科顯示。
1、孫益紅，男，主任醫師，教授，普外科副主任。現就職于復旦大學附屬中山醫院。沈坤堂，男，復旦大學附屬中山醫院，普外科，主任醫師。
2、孫益紅比沈坤堂經驗資深，發表學術論文20余篇，專業譯文20余萬字，參與編寫學術專著兩部。
3、孫益紅職位高，現任中國抗癌協會第八屆理事會理事、中國抗癌協會胃癌專業委員會副主任委員、上海醫學會普外科分會候任主任委員、上海市抗癌協會胃腸腫瘤專委會候任主任委員、中華醫學會外科學分會胃腸外科學組委員兼秘書。
兩位醫師都很厲害，但傅錦波更厲害一些。
傅錦波，男，主任醫師，碩士研究生導師。專業特長：擅長胃腸道腫瘤、炎性腸病、甲狀腺疾病、腹股溝疝、切口疝的腹腔鏡微創手術。
李良輝，男，副主任醫師，醫學博士，1994年畢業于福建醫科大學醫療系臨床醫學專業，獲醫學學士學位。擅長胃腸腫瘤、甲狀腺腫瘤以及疝氣的診治，腹腔鏡下胃腸腫瘤根治性切除手術
吳國豪 ，男，教授，主任醫師，博士生導師，外科學博士。 1964年12月出生，1986年畢業于浙江省溫州醫學院醫療系。1988年考入原上海醫科大學中山醫院普外科研究生，師從吳肇光教授、吳肇漢教授，從事普外科及臨床營養研究。1993年7月畢業，獲外科學博士學位。畢業后留復旦大學醫學院（原上海醫科大學）附屬中山醫院普外科從事醫療、教學、科研工作。1995年晉升為副教授。1997年--1998年赴瑞典Karolinska Institute做博士后工作，從事臨床營養研究工作，進行外科學及臨床營養研究工作，2001年晉升為教授。