有影響：
1）在海關的加工貿易核銷方面，要解釋清楚進料不足的原因；
2）在稅務的退稅方面，一般貿易報關單對應的進項稅，不能申報抵扣。
一、進口報關
1、首先提供到貨通知書、正本提單或電放保函換取單
2、將貨物提至海關監管倉庫
3、準備進口報關所需單證
①清單、發票、合同一式一份、報關、報檢委托書各一份
報關員又稱企業海關經紀人、企業報關人員。英文為Customs broker。
報關員代表所屬企業（單位）向海關辦理進出口貨物報關納稅等通關手續，并依此為職業的人員。
按照規定如實申報出口貨物的商品編碼、商品名稱、規格型號、實際成交價格、原產地及相應優惠貿易協定代碼等報關單有關項目，并辦理填制報關單、提交報關單證等與申報有關的事宜。
擴展資料：
報關員不是自由職業者。報關員只能受雇于一個依法向海關注冊登記的進出口貨物收發貨人或者報關企業，并代表該企業向海關辦理報關業務。我國海關法律規定禁止報關員非法接受他人委托從事報關業務。
報關員必須具備一定的學識水平和實際業務能力，必須熟悉與貨物進出口有關的法律、對外貿易、商品知識，必須精通海關法律、法規、規章并具備辦理報關業務的技能。
隨著世界經濟在調整中恢復發展，我國對外貿易仍保持平穩增長態勢，這也意味著外貿行業的人才需求依然旺盛。報關員為進出口貨物收發貨人辦理報關業務，因其專業性、技能性強，在崗位競爭中極具優勢。
據統計，截至2012年年底，在海關注冊登記的報關企業5759家，進出口貨物收發貨人53.53萬家，而海關在冊報關員僅7.837萬人。因此，我國報關員需求仍有很大缺口。
報關是指貨物、行李和郵遞物品、運輸工具等在進出關境或國境時由所有人或其代理人向海關申報，交驗規定的單據、證件，請求海關辦理進出口的有關手續。我國海關規定報關時應交納的單據、證件。有：進出口貨物報關單、進出口貨物許可證、商品檢驗證書、動植物檢疫證書、食品衛生檢驗證書以及提貨單、裝貨單、運單、發票、裝箱單等。
結關是指進口貨物、出口貨物和轉運貨物進入一國海關關境或國境必須向海關申報，辦理海關規定的各項手續，履行各項法規規定的義務；只有在履行各項義務，辦理海關申報、查驗、征稅、放行等手續后，貨物才能放行，貨主或申報人才能提貨。同樣，載運進出口貨物的各種運輸工具進出境或轉運，也均需向海關申報，辦理海關手續，得到海關的許可。貨物在結關期間，不論是進口、出口或轉運，都是處在海關監管之下，不準自由流通。
清關即結關，習慣上又稱通關。至于如何報關、結關和清關，請查閱"怎樣進行進出口貨物的申報、查驗和放行"。
報關時需要提交哪些單證
進出口商向海關報關時，需提交以下單證：
1、進出口貨物報關單。一般進口貨物應填寫一式二份；需要由海關核銷的貨物，如加工貿易貨物和保稅貨物等，應填寫專用報關單一式三份；貨物出口后需國內退稅的，應另填一份退稅專用報關單。
2、貨物發票。要求份數比報關單少一份，對貨物出口委托國外銷售，結算方式是待貨物銷售后按實銷金額向出口單位結匯的，出口報關時可準予免交。
3、陸運單、空運單和海運進口的提貨單及海運出口的裝貨單。海關在審單和驗貨后，在正本貨運單上簽章放行退還報關貢，憑此提貨或裝運貨物。
4、貨物裝箱單。其份數同發票。但是散裝貨物或單一品種且包裝內容一致的件裝貨物可免交。
5、出口收匯核銷單。一切出口貨物報關時，應交驗外匯管理部門加蓋"監督收匯"章的出口收匯核銷單，并將核銷編號填在每張出口報關單的右上角處。
6、海關認為必要時，還應交驗貿易合同、貨物產地證書等。
7、其它有關單證。包括：（1）經海關批準準予減稅、免稅的貨物，應交海關簽章的減免稅證明，北京地區的外資企業需另交驗海關核發的進口設備清單；（2）已向海關備案的加工貿易合同進出口的貨物，應交驗海關核發的"登記手冊"。
對報關期限的規定
報關期限是指貨物運到口岸后，法律規定收貨人或其代理人向海關報關的時問。根據我國海關法的規定，進口貨物的報關期限為從運輸工具申報進境之日起14天內，由收貨人或其代理人向海關報關，超過這個期限報關，由海關征收滯報金。
進境貨物滯報金的起收日期為運輸工具申報進境的第15天，而郵運進境的貨物滯報金為收件人接到郵局通知之日起的第15天。此外，轉遙運輸進境貨物滯報金起收回期有兩個：一是運輸工具申報進境之日起第15天，二是貨物運扭才旨運地之日起第15天。
滯報金的征收對象是進口貨物的收貨人或其代理人。日征金額為進口貨物到岸價格的0.5％，起征點為人民幣10元，不足者不征。需注意，這里指的進口貨物的到岸價格是由海關審定的正常的到岸價格，它是以外幣計價的。海關按應征收滯報金之日國家外匯牌價的買賣中間價折合人民幣。滯報金是由于進口貨物收貨人或其代理人超過法定期限向海關報關而產生的一種費用，不是罰款，海關出據的滯報金收據也不是罰款通知書。
海關規定報關期限和征收滯報金是為了運用行政手段和經濟手段，促使進口貨物及時報關，加速口岸運輸，使進口貨物早日投入生產和使用
怎樣進行進出口貨物的查驗
進出口貨物查驗是指海關在接受申報并審核報關單證的基礎上對進出口貨物進行實際校對檢查。查驗的目的是核對實際進出口貨物與報關單證所報內容是否相符，有無錯報、漏報、瞞報、偽報等情況，審查貨物的進出口是否合法，確定貨物的物理性質和化學性質。進出口貨物，除海關總署特準免驗的之外，都應接受海關查驗。海關查驗貨物，一般應在海關規定的時間和監管場所進行，如有理由要求海關在監管場之外查驗，應事先報經海關同意。海關在查驗時有以下要求：
1、貨物的收發貨人或其代理人必須到場，并按海關的要求負責辦理貨物的搬移、拆裝箱和重封貨物的包裝等工作。
2、海關認為必要時，可以徑行開驗、復驗或提取貨樣，貨物管理人員應當到場作為見證人。
3、申請人應提供往返交通工具和住宿，并支付有關費用，同時按海關規定交納規費。另外，我國海關法規定，海關在查驗進出境貨物品時，損壞被查驗的貨物，應當賠償實際損失。此時，由海關關員如實填寫《查驗貨物、物品損壞報告書》并簽字，一式兩份，查驗關員和當事人各留一份。雙方共同商定貨物的受損程度或修理費用，以海關審定的完稅價格為基數，確定賠償金額。賠款一律用人民幣支付。海關貨物放行的前提條件根據我國海關法的規定，除海關特準的貨物以外，進出口貨物在收發貨人繳清稅款或者提供擔保后，可由海關簽章放行。
海關對進出口貨物的報關，經過審核報關單據，查驗實際貨物，并依法辦理了征收稅費手續或減免稅手續后，在有關單據上簽蓋放行章，貨物的所有人或其代理人才能提取或裝運貨物。值得注意的是，口岸海關對進出口貨物的放行意味著：（1）對一般貿易進出口貨物，海關監管結束、（2）對需轉為海關以其他方式繼續監管的貨物，貨物進入另一種方式的海關監管；剛對需轉另一設關地點的貨物，則甲海關監管結束和乙海關監管開始。
怎樣進行進出口貨物申報
在國際貿易中，貨物的進出口必須向海關申報首先談一下進口貨物的申報： 1、申報時間。
進口貨物的收貨人應當自運輸工具申報進境之日起14日內，向海關申報。超過規定期限來自海關申報的，由海關從第15天起按日征收滯報金；如果自運輸工具申報進境之日起超過三個月未向海關申報，其進口貨物將由海關提取變賣。
2、申報應備文件及申報地點。
進口貨物申報時，應填寫一式兩份"進口貨物報關單"，并隨附以下單證：（1）許可證；（2）提貨單；（3）發票；（4）裝箱單；（5）減免稅或免驗的證明文件。根據規定，進口貨物應當由收貨人在貨物的進境地海關辦理海關手續。3、海關審核單證。海關在接受報關后，首先要對各項單證予以簽收，對報關單進行編號登記，并批注接受申報的日期；其次對交革的單證要認真細致地進行審核，如發現不合格時，應通知申報單位及時補充和更正。
下面再談一下出口貨物的申報：
1、申報時限和申報地點。出口貨物在出境時，其發貨人應在裝貨的24小時以前，向海關申報。具體地說，一般在出口貨物運到碼頭、車站、機場、郵局等倉庫、場地后，在海關規定的24小時以前向海關申報。根據規定，出口貨物應由發貨人在貨物的出境地海關申報。
2、報關應具備的單證。出口貨物報關時應填寫一式兩份"出口貨物報關單"并隨有出口許可證、發票、裝箱單等貨運單證。海關在接受報關后，同樣也需對各項單證予以簽收和審核。
3、出口產品退還國內產品稅。出口企業申請退稅，須提供兩單兩票，即出口貨物報關單、銀行的出口結匯單和出口銷售發票、出口產品購進發票；有權退稅的企業是有進出口經營權并承擔出口創匯任務的外貿公司，工業企業受托具有出口經營權的企業出口自產產品，也準予退稅。
如何進行關稅的征收與退補
關稅征收的過程是稅則歸類、稅率運用、價格審定及稅額計算的過程。進出口關稅的計算方法是：關稅稅額=完稅價格*進出口關稅稅率。進出口貨物的到、離岸價格是以外幣計算的，應由海關按照簽發稅款繳納證之日國家外匯牌價的中同價，折成人民幣。
按照規定，進口貨物的收貨人、出口貨物的發貨人、進出境物品的所有人是關稅的納稅義務人；同時有權經營進出口業務的企業也是法定納稅人。納稅人應當在海關簽發稅款繳納證的次日起七日內，向指定銀行繳納稅款；逾期不繳納的，由海關自第八天起至繳清稅款日上，按日征收稅款總額的1％的滯納金；對超過三個月仍來繳納稅款的，海關可責令擔保人繳納稅款或者將貨物變價抵繳，必要時，可以通知銀行在擔保人或納稅人存款內扣除。關稅的退補分補征、追征和退稅三種情況：
1、補征。是指進出口貨物、進出境物品放行后，海關發現少征或漏征稅款時，應當自繳納稅款或者貨物、物品放行之日起一年內。向納稅義務人補征。
2、追征。是指因納稅義務人違反規定而造成少征或者漏征的，海關在三年內可以追征。
3、退稅。是指海關多征的稅款，發現后應當立即退還；納稅義務人自繳納稅款之日起一年內，可以要求海關退還，逾期不予受理。
辦理退稅時，應做到退稅依據確實，單證齊全，手續完備。納稅單位應填寫退稅申請，連同原來稅款繳納書及其他必要證件，送經原征稅海關核實，并簽署意見，注明退稅理由和退稅金額。單位退稅，一律轉帳退付，不退現金。辦理退稅手續，除海關原因退稅外，由納稅單位向海關交納50元人民幣手續費。
我國的報關注冊登記制度
報關是指進出境的運輸工具負責人，進出口貨物的收發貨人或代理人向海關提出辦理進出口貨物手續的過程。向海關報關的人或單位稱之為報關人。需要向海關辦理報關手續的企事業單位，應向海關提出書面申請，經海關審核并辦理注冊登記手續。辦理了上述手續的單位，可以直接向海關辦理進出境運輸工具、貨物的報關手續，企事業指派的具體向海關辦理報關手續的人，應經過海關培訓、考核；未向海關辦理注冊登記手續的單位