復旦大學附屬
中山醫院：擅長肝癌的綜合治療、心血管病、呼吸內科，尤其是肝移植全國領先。
華山醫院：以神經外科、神經內科、皮膚科、骨科（尤其是手外科）為特長，江蘇路分部是乳腺專科。
華東醫院：老年病特色。
復旦大學附屬兒科醫院：主體已搬到閔行區顧戴路，小兒外科國內知名，分離過多例連體嬰兒。
復旦大學附屬腫瘤醫院：腫瘤科、病理科滬上領先。
復旦大學附屬眼耳鼻喉科醫院（五官科醫院）：眼科、眼視光、眼外傷、耳鼻喉各種疾病。
復旦大學附屬婦產科醫院（紅房子醫院）：不孕不育。
復旦大學附屬公共衛生臨床中心：原來的上海市傳染病醫院，收治各種法定傳染病。
上海交通大學醫學院附屬
瑞金醫院：血液科、燒傷科、內分泌科最強，腎臟科、消化科、感染科也在滬上前列。
仁濟醫院：以消化內科、風濕免疫科、神經外科、婦產科見長，也是上海人類精子庫所在地。
新華醫院：綜合性醫院，但兒科名揚全國，小兒心血管、小兒血液、小兒外科等在全國一流，水平遠高于兒童專科醫院。成人方面，心血管、消化、神經內科為重點學科。
上海兒童醫學中心：新華醫院下屬的兒童專科醫院，擅長兒童先天性心臟病手術。
上海交大附屬上海市兒童醫院：靜安區北京西路，在普陀區建有新院，遺傳病、小兒泌尿較有優勢。
上海市第一人民醫院：眼科、眼底病、中醫消化病、泌尿外科、心外科、器官移植處于前列。
上海市第六人民醫院：在糖尿病、斷肢再植（骨顯微外科）、超聲醫學等領域名揚全國。
上海市第九人民醫院：以口腔科、整復外科、關節外科為重點，是整形領域的領頭羊。
上海交大附屬上海市胸科醫院，徐家匯附近，在肺癌、心肺功能障礙、胸部積水等方面實力強。
上海市精神衛生中心：下屬上海市心理買粉絲中心，精神疾病、心理買粉絲等方面實力不錯。
國際和平婦幼保健院：徐家匯衡山路，開展試管嬰兒，不孕不育、婦女保健較強。
上海中醫藥大學附屬
龍華醫院：擅長中醫治療惡性腫瘤、骨退行性病變、腎病、風濕病、乳腺病、脾胃病、呼吸病等，其中以中醫外科和中醫腫瘤最為出名。
曙光醫院：盧灣和浦東張江都有，擅長中醫肝病、骨傷科、中醫腎病、糖尿病、脾胃病。
岳陽中西醫結合醫院：針灸推拿、中醫婦科、中醫血液科比較好。
市中醫醫院，位于閘北區芷江中路，中醫兒科、中醫失眠癥、中醫紅斑狼瘡等有特色。
第二軍醫大學附屬
長海醫院：楊浦區長海路，形成肝膽外科、胸心外科、燒傷外科、血管外科、血液內科、消化內科等特色學科。
長征醫院：頸椎病、脊柱病的手術（脊柱外科）全國有名，形成骨科、神經外科、器官移植、腎病、皮膚真菌病、多發傷救治等特色。
東方肝膽外科醫院：肝臟腫瘤、介入治療，復雜膽道手術以及肝移植等方面居國內先進水平。
同濟大學附屬
同濟醫院：原名甘泉醫院，并入同濟大學后才得以真正發展，心內科、精神醫學科稍好。
上海市肺科醫院：肺移植技術熟練，在職業病、肺部腫瘤、肺氣腫等領域領先。
同濟大學口腔醫院：上海唯一三甲口腔醫院，但不如九院的口腔科名氣大。
上海市第十人民醫院：中醫心腦血管病、視覺復明、創傷急救處于上海市內領先地位。
同濟大學附屬第一婦嬰保健院：產前診斷、圍產醫學較強。
分醫院詳細介紹，請點擊
1、復旦大學附屬中山醫院
心臟、肝癌、腎臟和肺部疾病診治是醫院的重點和特色，診治水平始終處于中國領先地位。其中心血管病和肝腫瘤為上海市臨床醫學中心。
2、上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院
上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院專長有血液科、燒傷科、內分泌科最強，腎臟科、消化科、感染科。
3、復旦大學附屬華山醫院
復旦大學附屬華山醫院以神經外科、神經內科、皮膚科、骨科（尤其是手外科）為特長，以第一批受國務院特殊津貼的皮膚病專家肖鷺白教授、趙書磊主任為首的皮膚科更是在全國享有盛譽。
4、上海長海醫院
上海長海醫院擁有肝膽外科、胸心外科、燒傷外科、血管外科、血液內科、消化內科等特色學科。
5、上海交通大學醫學院附屬仁濟醫院
上海交通大學醫學院附屬仁濟醫院以消化內科、風濕免疫科、神經外科、婦產科見長，也是上海人類精子庫所在地。
6、上海交通大學醫學院附屬新華醫院
上海交通大學醫學院附屬新華醫院在《2007全國醫院排名》中兒科排名名列第一，心血管病科排名名列第六。1993、1995年分別被國家衛生部授予三級甲等醫院和愛嬰醫院稱號。
7、上海交通大學附屬第九人民醫院
上海交通大學附屬第九人民醫院以口腔科、整復外科、關節外科為重點，是整形領域的領頭羊。
8、上海市第六人民醫院
上海市第六人民醫院在糖尿病、斷肢再植（骨顯微外科）、超聲醫學等領域名揚全國。
9、復旦大學附屬華東醫藥
華東醫院是國內外享有盛譽的一所綜合性醫院，老年病特色疾病為專長。
10、上海市第一人民醫院
上海市第一人民醫院眼科、眼底病、中醫消化病、泌尿外科、心外科、器官移植處于前列。
分級分等
等級醫院管理將醫院分成一、二、三級，一、二級醫院分別分為甲、乙、丙三等，三級醫院分為特、甲、乙、丙四等。
一級醫院：（病床數在100張以內，包括100張。[作者注]下同）是直接向一定人口的社區提供預防，醫療、保健、康復服務的基層醫院、衛生院。
二級醫院：（病床數在101張—500張之間）是向多個社區提供綜合醫療衛生服務和承擔一定教學、科研任務的地區性醫院。
三級醫院：（病床數在501張以上）是向幾個地區提供高水平專科性醫療衛生服務和執行高等教育、科研任務的區域性以上的醫院。企事業單位及集體、個體舉辦的醫院的級別，可比照劃定。（注：實際執行中，一級醫院不分甲、乙、丙三等的。醫院等級的劃分是按醫院的技術力量、管理水平、設備條件、科研能力等按1000分計分而劃分出來的）。
三級甲等醫院
醫院建設成績顯著，科室設置、人員配備、管理水平、技術水平、工作質量和技術設施等，按分等標準綜合考核檢查達900分及以上。
上海的三級甲等醫院有上海三甲大概有37家，上海交大附屬有 11所；復旦附屬有7所；同濟 附屬5所；上海中醫藥大學附屬4所，二軍大附屬3所。還有其它不屬于這些大學 的三甲 和 部隊醫院等。
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一級醫院大多指地段醫院與街道社區衛生服務中心。
寶山
寶山區中心醫院-寶山區中醫醫院-寶鋼醫院
吳淞中心醫院-大場醫院-中冶集團職工醫院
羅店醫院-寶山區傳染病醫院-上鋼一（二廠職工醫院
區婦幼保健院-第五冶職工醫院-十三冶職工醫院
寶鋼二十冶職工醫院-寶山區精神衛生中心-市公安局安康醫院
長寧
長寧區中心醫院-同仁醫院-武警總隊醫院
長寧區光華中西結合醫院-長寧區精神衛生中心-東方乳腺疾病醫院
長寧區婦幼保健院-天山中醫醫院-中國民航上海醫院
紡三醫院-電力醫院-區慢性病防治院
市房屋土地管局職工醫院
解放軍第八五醫院-解放軍四五五醫院-市皮膚病性病防治院
虹口
市第一人民醫院-市傳染病醫院-岳陽醫院
市中西結合醫院-第四人民醫院-海軍四一一醫院
曲陽醫院-虹口區精神衛生中心-上海市同濟大學醫院
江灣醫院-虹口區婦幼保健院-海員醫院
建工醫院-航道醫院-區牙防所
黃浦
黃浦區中心醫院-長征醫院-第九人民醫院
黃浦區傳染病院-仁濟醫院-上醫大婦產科醫院
黃浦區中醫醫院-華仁醫院-第二人民醫院
黃浦南市區精神衛生中心-上海港醫院-南市區中西結合醫院
南市區傳染病院-南市黃浦區婦幼保健院-南市區腫瘤醫院
區結核病病院-區眼防所-
市職業病防治院-紅光醫院-區牙防所
南市區精神衛生中心-市府大廈門診-市口腔病防治院
靜安
華山醫院-市眼科醫院-上海市兒童醫院
華東醫院-靜安區中心醫院-郵電職工醫院
公用事業局職工醫院-靜安區老年醫院-市第一婦嬰保健院
靜安區精神衛生中心-市化工職業病防治院-
盧灣
瑞金醫院-瑞金分院(市政醫院-盧灣區婦幼保健院
曙光醫院-瑞金醫院盧灣分院(盧中心-香山中醫醫院
區牙防所-區結核病病院-
東南醫院-盧灣區精神病防治中心-江南造船廠職工醫院
閔行
閔行區中心醫院-第五人民醫院-閔行區精神衛生中心
吳涇醫院-閔行區結核病醫院-閔行區中醫醫院
閔行區傳染病醫院-電氣集團職業病防治院-市民政第一精神院
浦東新區
東方醫院-浦東新區人民醫院-浦東新區結核病防治院
浦東新區公利醫院-第七人民醫院-浦東新區精神衛生中心
第三鋼鐵廠職工醫院--
浦東新區浦南醫院-浦東新區傳染病醫院-上海兒童醫學中心
浦東新區中醫醫院-浦東新區婦幼保健院-長江航運醫院
仁濟醫院（浦東-浦東新區中醫醫院羅山分院-
普陀
甘泉醫院-普陀區中心醫院-普陀區精神衛生中心
利群醫院（大眾老年護理醫院-普陀區中醫醫院-普陀區婦嬰保健醫院
紡一醫院-區眼牙病防治所-
徐匯
徐匯區中心醫院-第八人民醫院-龍華醫院
大華醫院-日暉醫院-中山醫院
宛平醫院-徐匯區精神衛生中心-市胸科醫院
兒科醫院-第六人民醫院-耳鼻喉科醫院
上海遠洋醫院-上海市精神病衛生中心-腫瘤醫院
市針灸經絡研究所門診部-氣功研究所門診